Expandindo os elementos de jogabilidade introduzidos em Ys: The Ark of Napishtim e desenvolvidos em Ys: The Oath in Felghana, Ys Origin aperfeiçoa a fórmula adicionando diferentes estilos de jogo e novos recursos nunca antes vistos no universo Ys. Melhor descrito como um RPG de plataforma estilo arcade com elementos Metroidvania e uma narrativa complexa e multifacetada, Ys Origin é a mistura perfeita de ação, exploração e história.